62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3461 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 84 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  97.62 
 
 		 84 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  91.67 
 
 		 84 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  65.48 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  57.14 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  64.18 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  58.75 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  58.75 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  57.35 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  58.82 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  55.7 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  55.7 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  55.7 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  69.62 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  54.32 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  54.32 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  54.32 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  56.58 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 80 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  53.23 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  48.57 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  41.56 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  41.77 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.77 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  44.9 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  45.95 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1065  Transglycosylase-associated protein  56.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0251318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  41.1 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  39.51 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  39.29 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.84 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 85 aa  40  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>