58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1472 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 86 aa  140  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 79 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 80 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  48.15 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  53.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  53.75 
 
 		 323 aa  62  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  53.75 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  53.75 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  46.58 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  47.06 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  53.75 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  53.75 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  53.75 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  53.85 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  48.19 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  38.36 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 85 aa  44.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  38.37 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  38.27 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.96 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>