68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1196 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
78 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 
79 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  60.56 
 
 
80 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  56.96 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  60.26 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
83 aa  63.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  50.65 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  51.52 
 
 
81 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  56.94 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  56.41 
 
 
323 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  56.41 
 
 
115 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  56.41 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  56.41 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  56.41 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  56.41 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 
116 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  55.84 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 
79 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  51.32 
 
 
86 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  48.19 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
85 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  47.76 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0730  Transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  43.53 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  48.94 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  48.94 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2575  hypothetical protein  37.5 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0709293  hitchhiker  0.00000060795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  55 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0866  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  43.66 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2868  Transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>