55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0221 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 84 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  65.48 
 
 		 84 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  65.48 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  59.52 
 
 		 84 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 		 84 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  66.67 
 
 		 84 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  58.23 
 
 		 323 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 		 84 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  61.76 
 
 		 89 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 		 79 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  55 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 84 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  55 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  55.22 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 83 aa  74.3  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  57.35 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  51.19 
 
 		 84 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 80 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  58.23 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  58.23 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  59.3 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 80 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  46.99 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  46.99 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  42.86 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 		 81 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  51.61 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  45.71 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  40.48 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  36.99 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1065  Transglycosylase-associated protein  57.75 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0251318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  33.78 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>