69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1208 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 79 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  62.03 
 
 		 80 aa  92  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 		 79 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 79 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  74.68 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  51.95 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  56.41 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  56 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  54.67 
 
 		 84 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  54.05 
 
 		 84 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  50.63 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0730  Transglycosylase-associated protein  75.95 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  51.28 
 
 		 323 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  51.28 
 
 		 115 aa  62  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  51.28 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  48.48 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  51.28 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 84 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  50.67 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  50.75 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  53.23 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  53.12 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  50.75 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  55.17 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  46.75 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  46.75 
 
 		 84 aa  48.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  34.72 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  41.77 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  39.39 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  41.43 
 
 		 84 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  38.75 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2868  Transglycosylase-associated protein  62.03 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  37.88 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  42.68 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>