124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3296 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
85 aa  153  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  85.88 
 
 
85 aa  137  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  58.82 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  58.82 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  75.9 
 
 
86 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  75.9 
 
 
86 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  52.33 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  59.3 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  56.47 
 
 
84 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  57.65 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  57.65 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  56.47 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  56.47 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  56.47 
 
 
84 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  55.81 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  55.81 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  55.81 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  55.81 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  55.81 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  52.33 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  46.25 
 
 
82 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  46.25 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  45.68 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  45.35 
 
 
88 aa  60.1  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 
85 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  35.06 
 
 
323 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  44.71 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
89 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 
84 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  45.98 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  42.7 
 
 
89 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  35 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  44 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  44 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  39.53 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  43.21 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  36.05 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.59 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  39.24 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  36.59 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  46.03 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40.79 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  36.47 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  33.72 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>