161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002896 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  100 
 
 		 82 aa  147  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  81.71 
 
 		 83 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  60.76 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  55.7 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  55.7 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  55.7 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  59.26 
 
 		 87 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  56.96 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  59.76 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  59.76 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  56.96 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  60.76 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  59.49 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  60.76 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  60.76 
 
 		 82 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  56.1 
 
 		 89 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  55.42 
 
 		 86 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  54.22 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  54.22 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  54.22 
 
 		 84 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  54.22 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  65.43 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  47.67 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 85 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  48.72 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  52.44 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  44.87 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  44.74 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  58.49 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  65.91 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  58.33 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  43.75 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  43.9 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  65.22 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  43.59 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  40.51 
 
 		 87 aa  52.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  43.21 
 
 		 323 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  41.77 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  43.21 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  44.16 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  48.15 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  38.89 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  38.46 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  36.84 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  49.38 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>