159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3560 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  155  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  56.63 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  63.16 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  64.38 
 
 		 84 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  61.64 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  62.16 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  56.25 
 
 		 84 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  58.11 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  60.27 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  60.27 
 
 		 84 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  59.21 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  54.32 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  57.89 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  59.21 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  54.32 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 81 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  56.96 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  56.58 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  56.06 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  52.63 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 90 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  58.06 
 
 		 81 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  45.78 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  58.06 
 
 		 81 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  49.4 
 
 		 90 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  45.12 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  45.12 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  50.75 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  43.9 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  44.78 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  56.36 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 98 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  47.44 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  44.78 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  44.29 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  44.29 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  50.82 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  43.75 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  46.77 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  44.78 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  58 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  48 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  39.47 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  43.24 
 
 		 82 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  56 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  56 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  56 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  39.02 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  39.02 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  39.02 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  37.8 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0275  transmembrane region and signal peptide prediction  37.66 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  45 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  37.18 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  48 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  51.92 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  48.08 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  44.62 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  39.71 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  35.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>