95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02247 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
90 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  71.91 
 
 
89 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  50 
 
 
83 aa  76.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  47.95 
 
 
83 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  54.41 
 
 
81 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  54.41 
 
 
81 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  49.32 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
81 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  50 
 
 
81 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  47.22 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
81 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  46.58 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  44.74 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  45.59 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  44.59 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  50.72 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 
88 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  50 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
83 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  50 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  48.57 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  45.71 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  46.43 
 
 
81 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  46.43 
 
 
81 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  47.14 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  47.14 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  44.29 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
87 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  50.79 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  43.1 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  40.74 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  35.37 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  39.51 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  47.76 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  47.76 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  44.9 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  44.9 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  44.9 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
90 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40.79 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0275  transmembrane region and signal peptide prediction  45.95 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  37.04 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  36.11 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  43.48 
 
 
223 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  40.82 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  40.82 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  40.82 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 
89 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  42.42 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3475  hypothetical protein  70.97 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  29.11 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  34.67 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  42.22 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  42.86 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  38.16 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  38.16 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>