105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4009 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  100 
 
 		 88 aa  157  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  72.62 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  65.91 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  57.95 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  61.36 
 
 		 101 aa  103  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  65.52 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  60.67 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  61.36 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  48.86 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  56.82 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  54.29 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  55.42 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  64.18 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  65.91 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  63.38 
 
 		 97 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  57.63 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  46.99 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  57.33 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  49.21 
 
 		 223 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  44.44 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  49.18 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  36.71 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  40.48 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  37.35 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  48 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  36.47 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  43.1 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  31.71 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  38.2 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  36.21 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  36.21 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  40.96 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  32.76 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  41.43 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  41.43 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 92 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  36.76 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  47.06 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  52.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  31.03 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  49.02 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  56.1 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>