37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2968 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  174  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  56.63 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  59.52 
 
 		 90 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  55.42 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  51.61 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  52.63 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  47.73 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  54.88 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  49.41 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  48.81 
 
 		 101 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  52.31 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  51.76 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  43.04 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  43.04 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  43.04 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  42.11 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  58 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  42.5 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  61.36 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  51.39 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  43.75 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  42.05 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  55.1 
 
 		 93 aa  53.5  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  59.09 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  80.65 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  59.09 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  59.09 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  60 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  46.27 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  57.14 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  43.66 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  34.09 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  35.44 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  47.46 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  52.5 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  47.62 
 
 		 89 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>