61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_38760 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  174  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  54.44 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  57.95 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  56.67 
 
 		 90 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  64.56 
 
 		 88 aa  96.7  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  57.95 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  58.43 
 
 		 101 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  54.88 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  54.88 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  54.88 
 
 		 102 aa  86.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  52.87 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  55.84 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  56.32 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  51.61 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  49.37 
 
 		 99 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  44.93 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  47.73 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  60 
 
 		 95 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  52.24 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  60.56 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  53.73 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  48.72 
 
 		 90 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  50 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  34.94 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  41.25 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  41.94 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  34.48 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  38.33 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  32.18 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  34.88 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  34.88 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  34.88 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  39.34 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  43.75 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  34.92 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  35.48 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  34.92 
 
 		 86 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  35.71 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  38.71 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  38.71 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>