88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3765 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  92.71 
 
 
101 aa  153  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  85.71 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  85.71 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  85.71 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  61.36 
 
 
88 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  60.82 
 
 
91 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  60.23 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  57.95 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  59.09 
 
 
90 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  62.07 
 
 
88 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  67.74 
 
 
95 aa  87  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  63.64 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  54.88 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  58.82 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  52.27 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  49.41 
 
 
93 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  56.67 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  45.07 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  43.88 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  38.64 
 
 
90 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
88 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
93 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  40.96 
 
 
223 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  46.97 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  35.23 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  37.63 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  42.03 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  42.03 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  39.71 
 
 
84 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
81 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  40.35 
 
 
84 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  39.71 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  39.71 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  38.24 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.71 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.71 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  39.13 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.71 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  37.68 
 
 
81 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  35.48 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  38 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  36.76 
 
 
84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  45.28 
 
 
92 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  41.25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  44.9 
 
 
88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  42.86 
 
 
88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  42.86 
 
 
88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  40 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  42.11 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 
87 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  40.82 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  33.82 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  36.17 
 
 
86 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  40.74 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  41.07 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  34.74 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  38.89 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  34.88 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  42.59 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  39.22 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  31.33 
 
 
83 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 
89 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>