86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4900 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 89 aa  163  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  60.92 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  55.17 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  56.32 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  60 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  57.33 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  43.88 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  49.44 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  54.39 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  45.98 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  43.62 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  44.32 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  47.31 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  55.77 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  61.22 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  72.22 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  42.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  42.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  42.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  59.09 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  53.33 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  42.67 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  44.29 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  44.71 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  54 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  56.82 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  49.06 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  44.62 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  40.26 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  47.92 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  52.83 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  50.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  50.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  50.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  50.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  50.94 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  48 
 
 		 87 aa  43.5  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  50.94 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  47.17 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  49.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  41.27 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  52.17 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  49.06 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  49.06 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  54.72 
 
 		 82 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  43.4 
 
 		 90 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  48.98 
 
 		 86 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  49.06 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  49.06 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  42 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  47.17 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  47.17 
 
 		 84 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  47.17 
 
 		 84 aa  40.8  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  52.83 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  43.14 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  43.42 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  43.14 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  52.38 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  45.28 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.74 
 
 		 90 aa  40  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  47.17 
 
 		 82 aa  40  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  40.38 
 
 		 102 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>