42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1447 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  100 
 
 		 99 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  77.78 
 
 		 93 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  61.18 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  49.37 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  46.99 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  48.75 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  43.59 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  48.68 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  44.62 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  48.05 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  43.75 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  45.21 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  45.21 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  45.21 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  41.67 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  37.63 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  36.46 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  47.13 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  44.78 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  39.24 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  35.9 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  50 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  40.68 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  34.18 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 		 93 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  37.65 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  34.52 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  51.06 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  47.92 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3475  hypothetical protein  47.92 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  36.67 
 
 		 223 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>