14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1471 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  100 
 
 		 100 aa  197  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  41.67 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  42.25 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  43.94 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  40.91 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  36.78 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  36.23 
 
 		 88 aa  50.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  37.5 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  31.46 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  32.97 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  42.55 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>