41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4179 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
91 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  72.62 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  60.82 
 
 
101 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  64.44 
 
 
101 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  64.77 
 
 
90 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  66.29 
 
 
90 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  59.52 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  59.52 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  59.52 
 
 
102 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  73.13 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  52.87 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  48.31 
 
 
90 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  51.11 
 
 
90 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  71.19 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  55.42 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  66.29 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  54.88 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  56.1 
 
 
90 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  69.01 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  44.19 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  49.23 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  47.31 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  49.18 
 
 
90 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
93 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  45.45 
 
 
223 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  36.47 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  43.64 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  43.64 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  43.64 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  42.86 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  46.94 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>