51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2260 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  165  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  46.59 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  49.43 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  49.43 
 
 		 88 aa  73.6  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  56.1 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  52.63 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  45.12 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  38.64 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  54.39 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  45.71 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  37.5 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  42.5 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  36.9 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  36.9 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  36.9 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  41.77 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  44.26 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  44.26 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  44.26 
 
 		 96 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  67.57 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  39.34 
 
 		 223 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  40 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  35.9 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  57.58 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 		 86 aa  42  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  43.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 90 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  34.94 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  37.78 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  34.67 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  41.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  33.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  33.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  33.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  33.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  33.73 
 
 		 82 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>