99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0110 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 97 aa  179  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  63.64 
 
 		 101 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  65.93 
 
 		 101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  64.04 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  62.92 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  64.2 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  64.2 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  64.2 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  77.08 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  61.8 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  66.29 
 
 		 91 aa  97.8  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  57.3 
 
 		 91 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  53.41 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  57.3 
 
 		 88 aa  88.2  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  61.76 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  52.81 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  47.14 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  47.87 
 
 		 89 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  46.15 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  57.35 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  46.07 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  43.18 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  45.31 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  45.31 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  45.31 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  45.31 
 
 		 223 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  55.93 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  48.39 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  41.11 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  39.78 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  36.07 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  36 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  50.98 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  31.88 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  49.02 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  40 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  51.11 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  37.5 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  36.11 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  36.11 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  34.72 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  34.67 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  31.76 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  34.72 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  38.2 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  34.72 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  30.12 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 90 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  43.33 
 
 		 83 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  46 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  38.2 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  38.2 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  38.2 
 
 		 82 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  43.33 
 
 		 82 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  39.29 
 
 		 82 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  40.28 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  33.71 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  33.96 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  38.98 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  34.83 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  45.61 
 
 		 87 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  32.14 
 
 		 81 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  36.9 
 
 		 82 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>