29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0056 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  100 
 
 		 90 aa  170  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  52.27 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  57.89 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  48.86 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  44.44 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  44.94 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  44.12 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  41.67 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  35.29 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  39.68 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  39.39 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  34.83 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  34.09 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  40.85 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  39.44 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  31.82 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  37.36 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  33.75 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  33.75 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  33.75 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 		 91 aa  42  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  32.14 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  31.76 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  35.96 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>