15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2571 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  206  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  84.96 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  45.57 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  49.09 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  50.91 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  41.25 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  54.55 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  39.24 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  41.11 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  41.25 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  49.02 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  48.08 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  47.27 
 
 		 91 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>