22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2768 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  209  7.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  84.96 
 
 
110 aa  152  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  46.84 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
90 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  43.75 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  41.05 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  39.36 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  36.56 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  43.06 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  40.45 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  39.24 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  44.23 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  40 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  40 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  40 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  47.06 
 
 
88 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  47.27 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  39.19 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  34.41 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  34.44 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>