50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2498 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  172  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  76.34 
 
 		 99 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  57.65 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  50.6 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  48.19 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  52.31 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  48.28 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  49.37 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  49.37 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  49.37 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  43.02 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  54.29 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  44.71 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  42.05 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  55.22 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  43.08 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  43.08 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  41.67 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  53.03 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  51.67 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  37.78 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  32.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 89 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  34.88 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  45.45 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  31.25 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  38.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  43.1 
 
 		 88 aa  43.9  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  33.71 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  40.38 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  38.89 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  30.23 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  43.64 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  43.64 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  35.14 
 
 		 110 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  36 
 
 		 114 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>