52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0503 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 91 aa  166  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  62.22 
 
 		 91 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  56.98 
 
 		 88 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  70.59 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  54.02 
 
 		 101 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  59.09 
 
 		 90 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  51.58 
 
 		 101 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  56.96 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  56.96 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  56.96 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  54.65 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  49.43 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  44.05 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  50.6 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  47.67 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  57.97 
 
 		 97 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  51.39 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  37.08 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  46.38 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  37.31 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  38.2 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  29.89 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  45.1 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  43.06 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  45.1 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  45.1 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  45.1 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  43.14 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  43.14 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  44 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  43.14 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  44 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  29.07 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  31.25 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  45.1 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  37.68 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  32.14 
 
 		 89 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  43.14 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  37.68 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  42.31 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  37.08 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  26.83 
 
 		 83 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>