67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3919 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  173  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  67.74 
 
 		 101 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  65.96 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  68.18 
 
 		 90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  65.22 
 
 		 90 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  77.08 
 
 		 97 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  65.48 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  65.48 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  65.48 
 
 		 102 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  65.91 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  57.95 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  65.17 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  51.69 
 
 		 90 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  60.92 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  54.12 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  52.27 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  64.62 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  45.45 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  45.71 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  51.43 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  48.15 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  58.82 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  51.52 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  56.67 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  38.89 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  40.96 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  39.76 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  42.11 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  38.37 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  39.13 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  34.21 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  35.53 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  32.89 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  32.89 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  31.58 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  41.43 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  31.58 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  40.58 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  31.33 
 
 		 83 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  31.58 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  42 
 
 		 83 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  31.82 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  49.02 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  36.11 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>