42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1729 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  156  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  69.77 
 
 		 90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  71.59 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  63.1 
 
 		 90 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  61.36 
 
 		 88 aa  100  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  64.56 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  65.91 
 
 		 91 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  62.07 
 
 		 101 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  54.65 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  57.3 
 
 		 101 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  56.79 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  56.79 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  56.79 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  58.21 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  56.82 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  52.63 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  51.35 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  61.97 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  65 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  62.71 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  64.15 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  50.79 
 
 		 90 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  48.68 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  45.45 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  38.18 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  46.03 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  44.23 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  44.07 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  39.24 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0056  integral membrane protein  42.03 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  39.39 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1471  integral membrane protein  35.29 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  42 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  43.4 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>