40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1048 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  63.1 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  53.41 
 
 		 90 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  48.86 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  55.84 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  48.31 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 		 90 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  56.1 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  54.88 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  49.4 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  49.4 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  49.4 
 
 		 102 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  55.56 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  48.05 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  52.24 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  45.68 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  50.75 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  54.39 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  44.32 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  42.11 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  41.86 
 
 		 93 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  49.3 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  48.05 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  45.57 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  41.27 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  50.94 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  38.55 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  41.82 
 
 		 223 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2768  hypothetical protein  47.46 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111053  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  45.65 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  43.14 
 
 		 81 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  41.27 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  42.59 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  39.22 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 81 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>