82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0966 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  71.26 
 
 		 91 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  62.07 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6910  transglycosylase-associated protein  64.37 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  60.71 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  59.09 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  59.09 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9244  transglycosylase-associated protein  62.07 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.652068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0503  transglycosylase-associated protein  74.58 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.83722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1729  hypothetical protein  65 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.593044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2399  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0803483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38760  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1048  hypothetical protein  49.43 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000383813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  54.02 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0965  transglycosylase-associated protein  59.7 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2968  hypothetical protein  46.99 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0110  transglycosylase-associated protein  61.97 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3919  hypothetical protein  62.26 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.121019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3461  hypothetical protein  41.1 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2498  hypothetical protein  51.52 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.049765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  41.38 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  44.83 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1447  putative transglycosylase associated protein  43.59 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718684  normal  0.0383994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  41.38 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  39.53 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  38.82 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  35.37 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  36.25 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  48 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2545  putative signal peptide  37.7 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  37.35 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  48 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  46 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  52.08 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2571  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.725276  normal  0.146538 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  42.11 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  45.1 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  37.74 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  37.14 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  42 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  42 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  44.07 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  39.34 
 
 		 85 aa  42  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  43.14 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  34.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 89 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  38.03 
 
 		 84 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  38.03 
 
 		 86 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  34.15 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  37.93 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  46.94 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  36.62 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  36.62 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  36.62 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  45.1 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  46 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 87 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>