174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1953 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 84 aa  153  7e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  98.81 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  98.81 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  98.81 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  98.81 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  98.81 
 
 		 84 aa  152  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  97.62 
 
 		 84 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  97.62 
 
 		 84 aa  150  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  92.77 
 
 		 86 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  92.77 
 
 		 84 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  91.57 
 
 		 84 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  91.57 
 
 		 84 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  91.57 
 
 		 84 aa  141  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  85.71 
 
 		 84 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  63.86 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  67.47 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  60.24 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  63.86 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  63.86 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  63.86 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  66.27 
 
 		 82 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  68.29 
 
 		 82 aa  90.1  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  69.51 
 
 		 82 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  55.95 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  67.07 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  67.07 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 89 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  48.86 
 
 		 88 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  46.51 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  51.9 
 
 		 83 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 89 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 		 87 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  46.15 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  43.53 
 
 		 90 aa  67.4  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  50.57 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  46.05 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 		 90 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  45.98 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  42.53 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  44 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  44 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  41.33 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  45.57 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  59.04 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  62.26 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  60.38 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  50.6 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  60.38 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  44 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  48.19 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  48.28 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  46.07 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  35.06 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1872  hypothetical protein  43.24 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.03815  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  40 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  45.98 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  40.26 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  44.71 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  43.28 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>