122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_23330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  160  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  62.07 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  63.64 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  57.3 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  53.41 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  47.73 
 
 		 89 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  54.55 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  52.5 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  51.72 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  50.6 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  49.4 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  46.07 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 84 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  49.45 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  45.98 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  46.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  47.78 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  46.67 
 
 		 84 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  48.15 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  48.15 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  48.15 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  42.05 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  45.56 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  47.13 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  65.22 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  42.86 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3565  hypothetical protein  56.25 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  43.68 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  48.1 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  60.87 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  60.87 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  47.27 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  42.03 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  54.35 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  61.9 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  60.87 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  39.56 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  54.9 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  34.09 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  56.82 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  34.09 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  59.09 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  39.56 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  40 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  38.89 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  43.08 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  54.55 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  40.38 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  36.78 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 		 89 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  36.26 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  48.98 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>