132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0332 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  54.65 
 
 		 90 aa  93.6  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  54.02 
 
 		 90 aa  87.8  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 		 89 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  57.47 
 
 		 87 aa  87.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  52.87 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  52.33 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  50.57 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 87 aa  81.6  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  48.28 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 		 89 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  49.43 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  45.57 
 
 		 86 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  45.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  45.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  47.37 
 
 		 84 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  43.04 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  43.04 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  43.04 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  40.51 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  40.96 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  39.76 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 		 82 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3565  hypothetical protein  57.53 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.35 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  36.78 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  36.78 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  39.77 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  41.77 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  46.07 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  44.07 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  56.52 
 
 		 90 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  56.82 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  34.44 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  44.83 
 
 		 223 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  52.17 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4009  putative transglycosylase associated protein  36.47 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.394825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  39.08 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0123  hypothetical protein  32.94 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  36.14 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0841  membrane protein  38.82 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0454928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  31.76 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  34.09 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  50 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>