169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2247 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  85.37 
 
 		 82 aa  134  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  130  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  89.02 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  85.37 
 
 		 82 aa  120  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  84.15 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 		 84 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  65.06 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  63.86 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  63.86 
 
 		 84 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  66.27 
 
 		 84 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  65.06 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  65.06 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  62.65 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 		 84 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  64.63 
 
 		 84 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  64.63 
 
 		 84 aa  95.9  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 83 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  63.29 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  54.88 
 
 		 86 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  60.76 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 		 89 aa  77.4  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 90 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  48.19 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  51.28 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  45.68 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  48.15 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  42.11 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  45.12 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  41.89 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  41.89 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  41.89 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  60.26 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  42.11 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  48.21 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  38.16 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  42.31 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 84 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  41.25 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  38.96 
 
 		 323 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  47.44 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  41.1 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  41.1 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  38.67 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1810  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1372  hypothetical protein  38.96 
 
 		 188 aa  50.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534627  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  42.53 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  37.04 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  44.12 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>