51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1372 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.534627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 89 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  39.19 
 
 		 82 aa  50.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 86 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 		 86 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  44.3 
 
 		 87 aa  48.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  34.21 
 
 		 86 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  32.91 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  47.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  32.91 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  33.77 
 
 		 82 aa  47.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  32.91 
 
 		 84 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 		 84 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  30.49 
 
 		 84 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 84 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  39.47 
 
 		 88 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 84 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 		 88 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  37.66 
 
 		 88 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  51.22 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 82 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  46.34 
 
 		 82 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  32.91 
 
 		 84 aa  42.4  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  48.78 
 
 		 82 aa  42  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 83 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 90 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  33.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>