187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1481 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 86 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  89.53 
 
 		 86 aa  147  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  54.88 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  56.1 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  56.1 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  56.1 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  56.1 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  56.1 
 
 		 82 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  56.63 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  56.63 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  87.8  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  87  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 		 84 aa  87  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  54.76 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  52.44 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 		 83 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  55.81 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 84 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  54.95 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  53.66 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  57.5 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  54.02 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  57.32 
 
 		 82 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  55.56 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  58.02 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  58.02 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  52.87 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  59.76 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  58.02 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  37.65 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  38.82 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  37.65 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  37.65 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  45.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  44.3 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  43.18 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  44.19 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  48.24 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  35.96 
 
 		 90 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  48.84 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  48.84 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  44.16 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  45.57 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  45.35 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  44.19 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  43.24 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  37.5 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  56.25 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  34.48 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4179  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0435054  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  39.29 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  54.72 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  45.57 
 
 		 102 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1810  hypothetical protein  43.53 
 
 		 94 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  37.68 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  46.27 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>