129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0261 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
87 aa  157  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  78.16 
 
 
88 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  68.97 
 
 
89 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  64.37 
 
 
90 aa  103  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  58.62 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  61.63 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  60 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  61.9 
 
 
91 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  54.55 
 
 
89 aa  83.6  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3565  hypothetical protein  71.83 
 
 
87 aa  80.1  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  52.87 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  48.19 
 
 
82 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 
84 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  48.24 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  48.24 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  48.24 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  48.24 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  48.24 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  49.43 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  46.43 
 
 
86 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  54.55 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  45.24 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
84 aa  67  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  57.69 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  47.44 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 
87 aa  63.5  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  46.99 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  44.87 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  42.22 
 
 
90 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  50.6 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  64 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
87 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  64 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  64 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24860  Transglycosylase associated protein  50.68 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  46.51 
 
 
87 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  49.4 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  46.99 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  44.59 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  39.08 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  51.92 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4900  transglycosylase-associated protein  50.94 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12745  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  34.48 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  34.88 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 
85 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  43.4 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 
87 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  32.94 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  57.14 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  49.02 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2260  hypothetical protein  41.67 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000880051  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0133  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0142  hypothetical protein  50 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>