139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2307 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  173  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.140114  normal  0.0177881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  71.76 
 
 		 102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4912  hypothetical protein  78.48 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.59341  hitchhiker  0.00462659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6898  hypothetical protein  68.09 
 
 		 101 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  50.54 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  47.31 
 
 		 90 aa  71.2  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  39.76 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  33.71 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  39.77 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  32.56 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  37.78 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  36.67 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  34.83 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  38.16 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  39.33 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  42.53 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  35.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4695  hypothetical protein  48.21 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  42.17 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  35.23 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  38.67 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  35.96 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  41.98 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  53.33 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  36.59 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  36.59 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  40 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  36.25 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  38.46 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  35.53 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  38.27 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2813  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000541683  hitchhiker  0.0000267282 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  41.33 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2813  hypothetical protein  37.35 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  45.21 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  34.44 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  32.97 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  35 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  32.95 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  33.73 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  32.93 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  34.44 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  55 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  34.44 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  30.68 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  33.73 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  31.71 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  32.53 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  36.47 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>