103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0554 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  80.43 
 
 		 97 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  79.35 
 
 		 92 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  79.35 
 
 		 92 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  77.17 
 
 		 98 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  77.53 
 
 		 90 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  70.45 
 
 		 88 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  64.2 
 
 		 87 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  64.63 
 
 		 87 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  62.96 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  59.26 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  60.98 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  59.76 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  58.75 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 96 aa  90.1  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  60.56 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  60.56 
 
 		 84 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  63.38 
 
 		 83 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 86 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  56.96 
 
 		 102 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  53.09 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  45.68 
 
 		 82 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  45.12 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  46.15 
 
 		 81 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  44.93 
 
 		 84 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  51.52 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  38.27 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  40.3 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 90 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  40.58 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 81 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  46.77 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  35 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  45.16 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  35.37 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  40.68 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  38.03 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  48.28 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  34.09 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  41.67 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  38.71 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  36.17 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  43.9 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  39.29 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  40.48 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  40.48 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  38.04 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.04 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  38.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  38.82 
 
 		 84 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  32.56 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  37.76 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>