108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0268 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 92 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  95.65 
 
 		 97 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  85.87 
 
 		 98 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  79.35 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  79.35 
 
 		 92 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  79.78 
 
 		 90 aa  142  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  69.41 
 
 		 88 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  67.06 
 
 		 87 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  64.2 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  60.98 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  62.96 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  59.26 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  58.54 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  60 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  57.5 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 		 86 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  64.29 
 
 		 96 aa  90.1  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  59.15 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  59.15 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  60.56 
 
 		 83 aa  87.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  51.25 
 
 		 102 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  51.85 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 82 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  46.91 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  46.27 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  48.05 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  50.72 
 
 		 84 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  45.12 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  43.21 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  47.44 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  47.37 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  47.83 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  47.83 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  41.67 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  40.85 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  48.48 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  47.14 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  51.56 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  50.63 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  37.88 
 
 		 83 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1810  hypothetical protein  41.46 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  39.02 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  38.03 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  41.25 
 
 		 82 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  43.37 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  44.05 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  44.05 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  42.17 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2638  putative transglycosylase associated protein  36.05 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  40.79 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  45.28 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  38.55 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  38.55 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  40.26 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  44.44 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  38.98 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  38.98 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  38.98 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  38.55 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>