138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5242 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
81 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  98.77 
 
 
81 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  97.53 
 
 
81 aa  147  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  93.83 
 
 
81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  88.89 
 
 
81 aa  136  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  86.42 
 
 
81 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  85.19 
 
 
81 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  87.5 
 
 
81 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  75 
 
 
81 aa  120  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  83.95 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  83.95 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  59.26 
 
 
85 aa  103  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  61.73 
 
 
83 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  60.49 
 
 
83 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  65.43 
 
 
83 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  62.96 
 
 
83 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  61.73 
 
 
82 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  60.26 
 
 
84 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  67.65 
 
 
80 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  61.54 
 
 
83 aa  87  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  59.21 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  53.09 
 
 
84 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  55.56 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
86 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 
86 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
87 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 
87 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  45.12 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  58.97 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  50.72 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 
87 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
87 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  49.4 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 
83 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  44.44 
 
 
90 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  46.27 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  50.72 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
92 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  53.66 
 
 
88 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  47.22 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  45.88 
 
 
88 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  44.44 
 
 
97 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  51.47 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  43.82 
 
 
88 aa  62  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  39.51 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  43.82 
 
 
88 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  42.03 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2796  hypothetical protein  36.25 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  46.05 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
86 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3144  hypothetical protein  35 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.027495 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  51.92 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  39.02 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2343  putative transglycosylase associated protein  40.28 
 
 
102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2390  putative transglycosylase associated protein  40.28 
 
 
102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448981  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2384  putative transglycosylase associated protein  40.28 
 
 
102 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  43.42 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  44.16 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  44.16 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  44.16 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
88 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  44.71 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  44.71 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  44.71 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  44.71 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  44.71 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  40.24 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  37.35 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3765  hypothetical protein  42.03 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  37.35 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  58.14 
 
 
223 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0275  transmembrane region and signal peptide prediction  39.47 
 
 
82 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  37.65 
 
 
87 aa  47  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  39.02 
 
 
83 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>