120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3115 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3115  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.891919  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3844  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 84 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3143  hypothetical protein  88.1 
 
 		 84 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.28458  normal  0.096168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  75.9 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  75.9 
 
 		 87 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  72.29 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  72.29 
 
 		 87 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  77.92 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  77.92 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  76.62 
 
 		 88 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  66.27 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0268  transglycosylase-associated protein  59.26 
 
 		 92 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.685198 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4856  transglycosylase-associated protein  70 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  60.49 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  58.75 
 
 		 90 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0561  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0547966  normal  0.0316187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0554  hypothetical protein  56.79 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2215  hypothetical protein  59.52 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  54.32 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  59.04 
 
 		 82 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  63.41 
 
 		 84 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  58.54 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  58.54 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7532  hypothetical protein  56 
 
 		 88 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  56.63 
 
 		 84 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  58.54 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  57.32 
 
 		 81 aa  84.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0892  hypothetical protein  58.9 
 
 		 102 aa  83.2  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1069  Transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 96 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  52.44 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  54.88 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  53.66 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  53.73 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  45.12 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  45.78 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3772  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4596  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436344  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5709  transglycosylase-associated protein  48.81 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.033399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3026  Transglycosylase-associated protein  52.86 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.264823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6212  hypothetical protein  56.1 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71590  hypothetical protein  54.88 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0944  putative transmembrane protein  50 
 
 		 83 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337988  normal  0.0425003 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.76 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0977  Transglycosylase-associated protein  47.27 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258897  normal  0.0607093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1009  hypothetical protein  47.44 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  53.57 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  52.38 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  48.24 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  51.19 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  45.35 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  45.35 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  47.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1810  hypothetical protein  41.18 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  47.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  47.06 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  38.27 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  43.18 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  36.36 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  37.08 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  44.3 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  40.74 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>