177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1365 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  91.46 
 
 
82 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  95.12 
 
 
82 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  86.59 
 
 
82 aa  119  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  85.37 
 
 
82 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  82.93 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  63.41 
 
 
82 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  68.67 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  66.27 
 
 
86 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  66.27 
 
 
84 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  68.67 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  68.67 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  68.67 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  68.67 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  67.47 
 
 
84 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  65.06 
 
 
84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 
84 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  65.06 
 
 
84 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  63.86 
 
 
84 aa  103  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  67.47 
 
 
84 aa  103  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  66.27 
 
 
84 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  64.63 
 
 
83 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  60.76 
 
 
83 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  56.1 
 
 
86 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  57.83 
 
 
87 aa  88.2  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 
86 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  48.19 
 
 
90 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  50.6 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002896  transglycosylase associated protein  56.96 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
88 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  52.56 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  47.56 
 
 
91 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 
87 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  50.62 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  44.74 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  41.67 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  62.82 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  40.79 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  40.79 
 
 
88 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  45.68 
 
 
89 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
87 aa  60.1  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  40.79 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  48.68 
 
 
84 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  37.35 
 
 
87 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  48.68 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  43.75 
 
 
323 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2009  transglycosylase-associated protein  53.57 
 
 
91 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000234681  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0941  transglycosylase-associated protein  48.21 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.44125  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  43.59 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  48.1 
 
 
88 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3818  hypothetical protein  51.85 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  39.47 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  39.24 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 
88 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  38.36 
 
 
89 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  42.03 
 
 
87 aa  50.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0635  transglycosylase-associated protein  45.31 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.325039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  39.02 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1810  hypothetical protein  44.3 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616432  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  38.82 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3870  membrane protein-like protein  43.64 
 
 
223 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0673943 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>