149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3787 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  98.86 
 
 
88 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  93.18 
 
 
88 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  72.09 
 
 
88 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  51.22 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1793  Transglycosylase-associated protein  47.13 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.899255  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  46.75 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  48.05 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  46.75 
 
 
86 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  48.05 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1248  transglycosylase-associated protein  51.81 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.251967  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  46.75 
 
 
84 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5046  transglycosylase-associated protein  46.07 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5231  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5620  transglycosylase-associated protein  49.4 
 
 
81 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.969683  normal  0.61306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  46.99 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  41.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2791  transglycosylase-associated protein  48.72 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  41.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5242  transglycosylase-associated protein  43.82 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.101174 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  48.31 
 
 
81 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5383  transglycosylase-associated protein  42.7 
 
 
81 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  44.94 
 
 
81 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  40.79 
 
 
82 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  38.16 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4051  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220096  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
84 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
86 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 
86 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  48.1 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
88 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0116  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01210  hypothetical protein  46.91 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  36.78 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  43.53 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  42.7 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  39.77 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0043  transglycosylase-associated protein  44.59 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  47.22 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
89 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
89 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  41.27 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
82 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1077  hypothetical protein  45.68 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  41.57 
 
 
87 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  39.68 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2831  transglycosylase-associated protein  47.76 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  46 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  46 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0057  hypothetical protein  38.64 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3351  hypothetical protein  34.88 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.396485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 
90 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 
87 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4920  transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4503  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 
87 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3475  hypothetical protein  57.45 
 
 
74 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  52.08 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4390  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4021  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.360585  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  39.56 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4946  Transglycosylase-associated protein  38.64 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177046  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2813  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>