105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6612 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 89 aa  167  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  43.68 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14550  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  46.91 
 
 		 89 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  41.76 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  38.89 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 84 aa  63.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  47.56 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  48.86 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  48.86 
 
 		 84 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  47.56 
 
 		 84 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  47.73 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  41.38 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  44.32 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  43.68 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  43.18 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  39.08 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  41.25 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 87 aa  51.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  38.16 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  39.47 
 
 		 82 aa  50.4  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23330  hypothetical protein  45.98 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0997983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  38.82 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3901  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37700  Transglycosylase associated protein  40.7 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  31.4 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  40.7 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0454  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.942807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  38.37 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0937  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.324449  normal  0.445038 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  45.83 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5334  transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1900  Transglycosylase-associated protein  41.11 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2982  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.26216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  34.78 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  28.57 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0510  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.694658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3881  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.64509  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  42.37 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0140  transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  38.98 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  39.08 
 
 		 84 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  34.09 
 
 		 83 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02247  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 90 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0479  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 		 98 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0385  Transglycosylase-associated protein  31.4 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5492  hypothetical protein  44.87 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0177  hypothetical protein  37.84 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>