51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3895 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 96 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  47.83 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  39.74 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  30 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  42.31 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  36.47 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  41.79 
 
 		 83 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  37.33 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2575  hypothetical protein  37.84 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0709293  hitchhiker  0.00000060795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  37.33 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  38.36 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  32 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  30.38 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  46.55 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3896  hypothetical protein  40.7 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691411  normal  0.341955 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  30.38 
 
 		 84 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  29.63 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  33.78 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  29.63 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  32.05 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  32.05 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  33.87 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>