49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3896 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3896  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.691411  normal  0.341955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  45.59 
 
 
85 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  43.59 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0332  hypothetical protein  37.65 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.084804 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  38.46 
 
 
86 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  38.46 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
88 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  37.18 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  37.18 
 
 
84 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.5 
 
 
82 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 
84 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
80 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  36 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  37.66 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  41.79 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>