51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2064 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  153  9e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  52.73 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  46.15 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  48.05 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  53.33 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  52.17 
 
 		 90 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  48 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  45.68 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  43.55 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  45.07 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  45.07 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  45.07 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  35.87 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  43.04 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  48.08 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  34.18 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  38.96 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  39.19 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  42.47 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  41.1 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  34.25 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  48.65 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  36.99 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  40.79 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>