27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2251 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 89 aa  161  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2498  Transglycosylase-associated protein  53.93 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0602129 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  45.35 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  43.37 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  42.7 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  43.82 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  41.86 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  43.33 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  36.84 
 
 		 88 aa  42  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 103 aa  42  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  31.33 
 
 		 323 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  38.75 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  44.68 
 
 		 87 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>