49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4838 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  52.78 
 
 		 87 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  52.81 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  51.69 
 
 		 86 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  34.48 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  36.25 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  42.86 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  34.12 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  34.78 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  38.27 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  35.37 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  38.3 
 
 		 83 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  40.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  40.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.07 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  32.14 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  46.34 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  38.27 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>