122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0212 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
86 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 
86 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  75.9 
 
 
85 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  73.49 
 
 
85 aa  119  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  58.82 
 
 
86 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  58.82 
 
 
86 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  52.33 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  58.14 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  51.16 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  51.16 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  50.59 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  51.76 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  51.76 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  50.59 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  50.59 
 
 
84 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  49.41 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  48.75 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  46.25 
 
 
82 aa  62.8  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  45.12 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  43.84 
 
 
323 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  44.19 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
85 aa  58.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  42.35 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
86 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
90 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
82 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 
90 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  48 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0996  transglycosylase-associated protein  41.76 
 
 
89 aa  52.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000193935  normal  0.29992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
88 aa  52  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 
89 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  47.22 
 
 
84 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  47.22 
 
 
84 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  47.22 
 
 
84 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
89 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  44.59 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  47.5 
 
 
82 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  43.21 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2608  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1481  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0384387  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2629  Transglycosylase-associated protein  47.67 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00228982  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0031  hypothetical protein  37.21 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  45.07 
 
 
117 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  46.48 
 
 
115 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  37.5 
 
 
101 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1150  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000224941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  39.77 
 
 
87 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  41.03 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  45.07 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  45.07 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  45.07 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  38.16 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  34.88 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.03 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1484  hypothetical protein  39.33 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  34.88 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  30.23 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  34.48 
 
 
89 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>