85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1287 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
80 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  63.29 
 
 
80 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 
80 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  53.75 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 
79 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  53.16 
 
 
323 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 
84 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  50.65 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 
84 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  53.16 
 
 
115 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  51.9 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  53.16 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  53.16 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  53.16 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  53.16 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  46.25 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  53.25 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 
84 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  45.45 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
116 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  48.68 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  43.75 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  43.75 
 
 
86 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  53.16 
 
 
79 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  48.68 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  41.46 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  46.38 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  45.21 
 
 
83 aa  52  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  43.84 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  48.78 
 
 
87 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  41.18 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
83 aa  50.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  45.83 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  51.61 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  42.5 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  47.06 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  45.21 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  46.97 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  41.46 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  48 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  48 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  44.78 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  43.28 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  37.8 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  48.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  37.8 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  41.94 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  37.8 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  38.81 
 
 
89 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
83 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  45 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  43.24 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  47.69 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
90 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  39.29 
 
 
82 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>